醫院污水特別是方艙醫院污水其污水水質性質和生活污水差不多，不同就是污水內可能菌群超標，需要在污水處理設備末尾的消毒工藝上適當延長污水消毒時間，醫院廢水處理設備運行模式為全自動運行模式，可以去除污水當中的COD、BOD、氨氮、大腸桿菌等污染物。
為達到中出水水質要求，本污水處理工藝包含預處理（格柵、調節池）、二級處理（生化+MBR池）、消毒等環節。
加強處理效果的一級強化處理適用于處理出水進入二級處理城市污水處理廠的綜合醫院。二級處理工藝適用于傳染病醫院(包括帶傳染病房的綜合醫院)和排入自然水體的綜合醫院污水處理。
醫院的污水，除一般生活污水外，還含有化學物質、放射性廢水和病原體。因此，必須經過處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來的污水，須經消毒后才可排放。
醫院廢水處理設備采用國際生物處理工藝，在總結國內外生活廢水處理裝置的運行經驗的基礎上，結合自己的科研成果和工程實踐，設計出一種可地埋設置的成套有機廢水處理裝置，集去除BOD5、COD、NH3-N于一身，具有技術性能穩定可靠、處理效果好、投資省、自動化運行、維護操作方便、不占地表面積、不需蓋房、不需采暖保溫等優點。地面之上可種花種草，不影響周圍環境。
